日時：2022年10月6日（木）13:30-
場所：理学部5号館413号室
講師：Anupam Sengupta (the University Luxembough)
題目： Microbial Active Matter
要旨：Understanding how microbes interface, exchange and communicate
with their local surroundings is central to the grand quest for a theory
of microbial ecology. From simple to complex fluids, from compliant to
rigid environments, microbes inhabit plethora of dynamic settings
spanning vastly different structures, internal energies, and interacting
cues. Currently we lack a biophysical framework that could explain,
generalize, and crucially, predict the if-s, the how-s, and the why-s
of the microbe-environment feedbacks. Research in our lab aims to fill
this gap by interfacing soft and active matter physics with microbiology
and genetic engineering, often with generous support of 3D
microfabrication, automation, quantitative imaging and machine learning
tools. Using vignettes from our recent works in bacterial and
phytoplankton systems [1-4],we will see microbes – under ecologically
relevant settings – in an active matter framework, and discuss their
individual and collective traits (behavior and physiology) in the
context of microbial adaptation to changing environments. I will
highlight the generality of our results across populations and taxa,
touching upon concepts of emergent intelligence associated with the
active microbial matter at collective scales. I will conclude by
showcasing some of our recent efforts to leverage the microbes-
mechanics-materials nexus in understanding functions of microbes
associated with specific cancer types, and more broadly, to harness the
biophysical feedbacks for the next generation of bioremediation and
diagnostic tools.
[1] Sengupta, Carrara, & Stocker, Nature 543, 555-558, 2017
[2] Sengupta, Dhar, Danza, Ghoshal, Müller, Kakavand, Science Advances (in press)
[3] You, Pearce, Sengupta, Giomi, Physical Review X 8, 031065, 2018
[4] Sengupta, Frontiers in Physics 8, 2020
[5] Dhar, Thai, Ghoshal, Giomi, & Sengupta, Nature Physics 18, 945-951, 202
これまでのセミナー
日時：2019年5月27日（月）10:30-
場所：理学部5号館413号室
講師：Armand Barbot (Ecole Normale Superieure, France)
題目： Characterization of shear bands and plasticity in model glasses at the atomic scale
日時：2018年6月12日（火）13:30-
場所：理学部5号館401号室
講師：藤谷洋平氏 （慶応大学)
題目： Drag coefficient of a circular liquid domain in a flat fluid
membrane a bit close to the demixing critical point
日時：2017年9月8日（金）14:00-
場所：理学部5号館401号室
講師：Ram Adar (School of Physics and Astronomy, Tel Aviv University, Israel)
題目： Bjerrum pairs in ionic solutions: a Poisson-Boltzmann approach
日時：2017年4月26日（水）16:00-
場所：基礎物理学研究所 研究棟・講義室 K206 (場所に注意)
講師：Subhadeep Roy (Earthquake Research Institute, University of Tokyo)
題目： Fracture in Different Scales: A Statistical Mechanical Approach
日時：2017年2月21日（火）13:30-
場所：理学部5号館401号室
講師： 高江 恭平氏 (東京大学)
題目：Ferroelectric glass of spheroidal dipoles with impurities
日時：2016年12月7日（水）15:00-
場所：基礎物理学研究所 研究棟・講義室 K206 (場所に注意)
講師：Anael Lemaitre (NAVIER, URM 8205, Ecole des Ponts, IFSTTAR, CNRS, UPE, France)
題目：Anomalous phonon scattering and elastic correlations in amorphous solids
日時：2016年11月28日（月）13:30-
場所：理学部5号館413号室
講師：Lee, Kuang-Wu (Friedrich-Alexander-University, Erlangen, Germany)
題目：Mesoscopic Simulation of Nematic Liquid Crystals in Microfluidics
日時：2016年3月15日（火）13:00-
場所：理学部5号館401号室
講師：Tatsuya Ishiyama (石山 達也氏) (Graduate School of Science and Engineering, University of Toyama )
題目：Molecular Dynamics Study of Structure and Spectroscopy at Liquid Interface
日時：2015年12月8日（火）13:00-
場所：理学部5号館401号室
講師：Itsuo Hanasaki (花崎 逸雄氏) (Tokyo University of Agriculture and Technology)
題目：Applied statisitical mechanics for engineering: from molecular dynamics and coarse-graining
to big data analysis of fluctuation measurements and single-particle characterization
日時：2015年11月17日（火）13:00-
場所：理学部5号館401号室
講師：Tsuyoshi Yamaguchi (山口 毅氏) (Nagoya University)
題目：Theory on dynamics of electrolyte solutions: Interplay between dynamics of bound pairs and ionic atmosphere
日時：2015年11月13日（金）17:00-
場所：理学部5号館401号室
講師：Kyohei Takae (高江 恭平氏) (University of Tokyo)
題目：Water in a Capacitor: Structure, Fluctuation, and Response
日時：2015年6月16日（火）13:00-
場所：理学部5号館401号室
講師：Takuya Sugimoto (Graduate School of Life and Environmental Sciences, University of Tsukuba)
題目：Aggregation Rates of Charged Colloidal Particles in a Couette Flow: Trajectory Analysis with Non-linear Poisson-Boltzmann Solution
日時：2015年6月2日（火）13:30
場所：理学部5号館401号室
講師：Hayato Shiba （芝 隼人）(The University of Tokyo)
題目：Membrane simulation - elasticity, surface tension, and some applications
日時：2015年1月20日（火）15:00
場所：理学部5号館401号室
講師：Toshiki Mima （美馬 俊喜氏）(The University of Tokyo)
題目：Molecular dynamics simulation of fluids in nanopores
日時：2014年11月18日（火）10:30
場所：理学部5号館413号室
講師：Jack F. Douglas (National Institute of Standards and Technology)
題目：Cooperative Motion and Structural Relaxation in Glass-Forming Materials
日時：2014年11月11日（火）13:00
場所：理学部5号館401号室
講師：Hiroaki Yoshida (Toyota Central R&D Labs.)
題目：Analysis of electrokinetic transports of nano-confined electrolyte solutions by means of the molecular dynamics simulations
日時：2014年8月27日（水）13:30
場所：理学部5号館413号室
講師：Anael Lemaitre (Laboratoire Navier (UMR 8205), Universite Paris-Est, France)
題目：Structural relaxation is a scale-free process
日時：2014年5月14日（水）15:30
場所：理学部5号館413号室
講師：Mohammad Reza Mozaffari (University of Qom, Qom, Iran )
題目：Pair interaction between colloidal particles in nematic liquid crystal
日時：2013年11月15日（月）16:00
場所：理学部5号館401号室
講師：AMiha Ravnik (Faculty of Mathematics and Physics, University of Ljubliana, Centre of Excellence NAMASTE, Slovenia)
題目：Topological superstructure in nematic liquid crystal colloids
日時：2013年4月22日（月）13:30
場所：理学部5号館413号室
講師：Dr. Flavio Romano (Department of Chemistry, University of Oxford, UK JSPS Fellowship, University of Tokyo)
題目：OxDNA: a coarse-grained model for simulations of DNA
場所：理学部5号館413号室
講師：Jure Dobnikar (Department of Chemistry, University of Cambridge and Jozef Stefan Institute, Ljubljana, Slovenia)
題目：Field-induced self-assembly of suspended colloidal membranes
日時：2012年11月14日（水）16:00
場所：理学部5号館413号室
講師：Paddy Royall ((Bristrol University, UK)
題目：Colloidal and metallic liquids out of equilibrium : linking structure and kinetics
日時：2012年9月11日（火）14:30
場所：理学部5号館401号室
講師：Francesca Serra （イタリア ミラノ大学 9/7-12/6まで相転移に滞在）
題目：Memory from topology: an experimental point of view
日時：2012年7月12日（木）10:30
場所：理学部5号館413号室
講師：波多野 恭弘氏 (東京大学 地震研究所)
題目：Granular friction in a wide range of shear rates
日時：7月11日（水）15:30
場所：理学部5号館413号室
講師：Nasser Mohieddin Abukhdeir (Japan Society for the Promotion of Science Visiting Fellow* National Institute of Advanced Industrial Science and Technology (AIST) Tsukuba, Ibaraki Prefecture, Japan)
題目：Formation and Dynamics of Smectic-A Liquid Crystals
日時：2012年7月10日（火）13:30
場所：理学部5号館401号室
講師：貞包 浩一朗氏 (KEK)
題目：The shear effects on a mixture of water / organic solvent / antagonistic salt
日時：2012年4月23日（月）16:00
場所：理学部5号館401号室
講師：Daniel Beysens (CEA and ESPCI, Paris, France)
題目：Adsorption on colloids and flocculation
日時：2010年9月3日(金）午後３時-
場所：理学部５号館４０１号室
講師： Didier R. Long (Laboratoire Polymeres et Materiaux Avances: CNRS/Rhodia; Rhodia Reserches et Technologies, France)
題目： Slow domains percolation in polymer melts and blends close to the glass transition: a unifying concept regarding bulk dynamics, dynamics in the vicinity of interfaces, and the physical properties of nanocomposites
日時：2009年1月21日(木）15時30分-
場所：理学部５号館４１３号室
講師：Prof. Turab Lookman (Theoretical Division, Los Alamos National Laboratory, Los Alamos, USA)
題目：Microstructure and glassy phenomena for ferroelastic transitions in two and three dimensions using strain pseudo-spin models
